Software de código abierto

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Software de código abierto#

Introducción#

Cuando llega el momento de seleccionar un programa de software para el análisis de imágenes, hay muchas opciones, algunas más generales y otras altamente especializadas en modalidades de imágenes o tipos de experimentos específicos. En general, un buen lugar para comenzar a explorar es examinar documentos en su campo y ver lo que otros han usado para analizar experimentos similares al suyo. Es importante tener en cuenta que no hay una respuesta correcta a «¿Qué programa debo usar?» Dependiendo de su pregunta biológica, sus imágenes y su propia comodidad con la programación, hay muchas opciones disponibles.

A continuación, resumimos los casos de uso y las limitaciones de algunos de los software más comunes, gratuitos y de código abierto para el análisis de imágenes. Esta es una pequeña lista y existen otras más extensas como la Guía del autoestopista a través del software de análisis de bioimágenes universo ³ y el BioImage Informatics Index { cite}Paul-Gilloteaux2021-vw.

Cualquiera que sea el software que elija, asegúrese de incluir una descripción detallada de su análisis en sus métodos, con archivos de canalización o de flujo de trabajo si es posible, para que otros puedan reproducir su trabajo. ¡También asegúrese de citar el software de análisis que utiliza! Esto ayuda a los desarrolladores del software a obtener subvenciones y ayuda a otros a encontrar herramientas útiles.