Seguimiento de objetos#
¿Qué es el seguimiento?#
El seguimiento, o seguimiento de objetos, se refiere a la capacidad de estimar la ubicación de objetos en movimiento de un cuadro de video al siguiente. Prácticamente, el seguimiento de objetos en microscopía implica identificar sus objetos en cada cuadro de su video, luego relacionar objetos de cuadro a cuadro para poder identificar la misma celda a medida que se mueve en el espacio.
📏 ¿Cómo lo mido?
Hay varias opciones para rastrear objetos, como el plugin TrackMate 20 en Fiji, pero el rastreo es algo más complejo de configurar que los tipos de análisis previamente discutidos. Además de solo identificar objetos en la película/serie temporal, el seguimiento también le permite identificar eventos de división (p. ej., mitosis) y fusión. Hay muchas medidas que surgen del seguimiento, incluidas medidas espaciales como hacia dónde se mueven los objetos, medidas de velocidad, distancia recorrida (longitud de la pista) y tasa de eventos de división (por ejemplo, eventos mitóticos) y eventos de fusión.
⚠️ ¿Dónde pueden salir mal las cosas?
** segmentación pobre** Si los objetos se pierden de cuadro a cuadro, esto hace que sea más difícil rastrearlos con el tiempo. La
segmentación
precisa {term} es la base de buenos resultados de seguimiento. Esto puede volverse más difícil si sus objetos también cambian de forma o intensidad (debido a cosas como la decoloración) en el transcurso del video. Es importante encontrar una estrategia desegmentación
de {term} que pueda funcionar bien en todos sus marcos.Velocidad de adquisición inadecuada Si los objetos son muy dinámicos pero las imágenes no se tomaron a una frecuencia alta, el seguimiento puede ser difícil porque los objetos pueden haberse movido demasiado para que el algoritmo los relacione de un fotograma al siguiente. Es importante hacer coincidir la frecuencia de adquisición de imágenes con la dinámica de sus células u objetos.
📚🤷♀️ ¿Dónde puedo obtener más información?
🌐 [Manual de TrackMate] (https://imagej.net/media/plugins/trackmate/trackmate-manual.pdf)